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Savoir-faire « clés » en protéomique

  • Préparation d'extraits protéiques à partir de tissus, de cellules, ou de fluides biologiques
  • Electrophorèse 2D
  • Spectrométrie de masse
  • Recherche de protéines d'intérêt par analyses différentielles quantitatives

Au sein de la plateforme PPUP13

La plateforme est régulièrement sollicitée pour la mise en place de projets en protéomique par des équipes de recherche du site et par des équipes hors Université Paris 13 situées à Paris, en région parisienne et à l’étranger. Ces projets portent essentiellement sur - la réalisation d’analyses différentielles quantitatives pour la mise en évidence de protéines impliquées dans des pathologies, ou dans la réponse cellulaire à des molécules chimiques ou biologiques - l'identification de complexes protéiques - l'analyse de sécrétomes - l'analyse des phosphoprotéines.

Au sein de l'unité CSPBAT

Classiquement, l’évaluation de la bio-réactivité des biomatériaux vis-à-vis des protéines circulantes est effectuée par détection d’une protéine d’intérêt parmi celles retenues sur le support. Ces approches «ciblées» ne permettent pas, cependant, d’identifier l’ensemble des protéines adsorbées sur le biomatériau. En associant plusieurs approches analytiques en protéomique (chromatographie liquide, électrophorèse bidimensionnelle, spectrométrie de masse), il est possible d'identifier et de comparer quantitativement l'ensemble des protéines adsorbées sur différents supports.  Nos travaux réalisés sur des biomatériaux modifiés chimiquement avec du polyNaSS ont permis de mettre en évidence une capacité d’adsorption protéique accrue du biomatériau par rapport à celui non modifié ainsi qu’une sélectivité d’adsorption de cette surface vis-à-vis de certaines protéines. Par analyse protéomique comparative, nous étudions la cinétique d'adsorption des protéines plasmatiques sur les biomatériaux ainsi que les modifications protéomiques cellulaires induites par contact avec le biomatériau.

 

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